Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms