Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms