Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms