Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC0.49□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC0.47□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
COL4A6Q14031 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
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COL4A6Q14031 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
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COL4A6Q14031 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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COL4A6Q14031 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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COL4A6Q14031 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
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