Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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PDE6HQ13956 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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PDE6HQ13956 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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PDE6HQ13956 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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PDE6HQ13956 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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PDE6HQ13956 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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PDE6HQ13956 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
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PDE6HQ13956 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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