Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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