Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CDH18Q13634 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CDH18Q13634 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDH18Q13634 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CDH18Q13634 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDH18Q13634 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDH18Q13634 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDH18Q13634 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDH18Q13634 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDH18Q13634 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CDH18Q13634 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CDH18Q13634 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDH18Q13634 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CDH18Q13634 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CDH18Q13634 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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CDH18Q13634 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CDH18Q13634 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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CDH18Q13634 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDH18Q13634 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CDH18Q13634 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDH18Q13634 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDH18Q13634 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CDH18Q13634 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDH18Q13634 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDH18Q13634 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CDH18Q13634 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDH18Q13634 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CDH18Q13634 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDH18Q13634 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDH18Q13634 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDH18Q13634 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDH18Q13634 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDH18Q13634 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDH18Q13634 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDH18Q13634 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDH18Q13634 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDH18Q13634 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CDH18Q13634 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CDH18Q13634 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CDH18Q13634 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDH18Q13634 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDH18Q13634 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDH18Q13634 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDH18Q13634 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CDH18Q13634 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CDH18Q13634 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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