Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC0.28□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
ATRQ13535 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
ATRQ13535 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
ATRQ13535 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ATRQ13535 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ATRQ13535 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ATRQ13535 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
ATRQ13535 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
ATRQ13535 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
ATRQ13535 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
ATRQ13535 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
ATRQ13535 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
ATRQ13535 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
ATRQ13535 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
ATRQ13535 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
ATRQ13535 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
ATRQ13535 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.37
ATRQ13535 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
ATRQ13535 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRQ13535 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRQ13535 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRQ13535 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRQ13535 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRQ13535 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRQ13535 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRQ13535 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRQ13535 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRQ13535 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRQ13535 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRQ13535 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRQ13535 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRQ13535 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRQ13535 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRQ13535 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATRQ13535 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ATRQ13535 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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