Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms