Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PMS2P3Q13401 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms