Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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SKP2Q13309 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
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SKP2Q13309 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
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SKP2Q13309 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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SKP2Q13309 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
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SKP2Q13309 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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SKP2Q13309 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
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SKP2Q13309 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
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SKP2Q13309 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
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SKP2Q13309 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
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SKP2Q13309 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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