Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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