Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
DUSP4Q13115 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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