Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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