Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
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IFT88Q13099 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
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IFT88Q13099 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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IFT88Q13099 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
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IFT88Q13099 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
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IFT88Q13099 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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