Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RAB40BQ12829 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.1 ms