Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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HOXD13P35453 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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HOXD13P35453 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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HOXD13P35453 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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HOXD13P35453 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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HOXD13P35453 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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HOXD13P35453 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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HOXD13P35453 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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HOXD13P35453 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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HOXD13P35453 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD13P35453 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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