Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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HOXD10P28358 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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HOXD10P28358 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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HOXD10P28358 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
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