Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRCP08575 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRCP08575 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRCP08575 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRCP08575 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRCP08575 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PTPRCP08575 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PTPRCP08575 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PTPRCP08575 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PTPRCP08575 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PTPRCP08575 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.93
PTPRCP08575 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PTPRCP08575 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PTPRCP08575 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PTPRCP08575 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.93
PTPRCP08575 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PTPRCP08575 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PTPRCP08575 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.93
PTPRCP08575 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.93
PTPRCP08575 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.93
PTPRCP08575 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.93
PTPRCP08575 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.93
PTPRCP08575 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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PTPRCP08575 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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PTPRCP08575 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
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PTPRCP08575 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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PTPRCP08575 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRCP08575 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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