Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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