Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CRXO43186 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CRXO43186 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CRXO43186 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CRXO43186 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CRXO43186 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CRXO43186 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CRXO43186 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CRXO43186 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
CRXO43186 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CRXO43186 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CRXO43186 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CRXO43186 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CRXO43186 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CRXO43186 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CRXO43186 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CRXO43186 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CRXO43186 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CRXO43186 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CRXO43186 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CRXO43186 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CRXO43186 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CRXO43186 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CRXO43186 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CRXO43186 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CRXO43186 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CRXO43186 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CRXO43186 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CRXO43186 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CRXO43186 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
CRXO43186 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
CRXO43186 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CRXO43186 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CRXO43186 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
CRXO43186 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CRXO43186 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CRXO43186 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CRXO43186 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CRXO43186 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CRXO43186 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CRXO43186 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CRXO43186 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CRXO43186 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CRXO43186 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CRXO43186 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CRXO43186 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CRXO43186 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CRXO43186 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CRXO43186 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CRXO43186 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CRXO43186 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CRXO43186 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CRXO43186 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CRXO43186 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CRXO43186 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CRXO43186 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CRXO43186 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CRXO43186 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CRXO43186 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CRXO43186 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CRXO43186 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CRXO43186 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CRXO43186 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CRXO43186 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CRXO43186 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CRXO43186 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CRXO43186 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CRXO43186 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CRXO43186 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CRXO43186 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CRXO43186 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CRXO43186 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CRXO43186 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CRXO43186 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CRXO43186 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
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