Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC0.16□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC0.16□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.15□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.14□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC0.14□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC0.13□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
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