Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
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