Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
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