Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC4□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC4□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC4□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC4□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC4□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC4□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC4□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC4□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC4□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC4□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC4□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC4□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC4□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC4□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC4□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBXN4Q92575 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169 ms