Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB6CQ53S08 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB6CQ53S08 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB6CQ53S08 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB6CQ53S08 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB6CQ53S08 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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