Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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CCDC142Q17RM4 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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CCDC142Q17RM4 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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CCDC142Q17RM4 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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