Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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RTN1Q16799 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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RTN1Q16799 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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RTN1Q16799 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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RTN1Q16799 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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RTN1Q16799 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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RTN1Q16799 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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RTN1Q16799 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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RTN1Q16799 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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