Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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