Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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