Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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