Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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CCDC6Q16204 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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