Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USF2Q15853 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USF2Q15853 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USF2Q15853 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
USF2Q15853 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.4□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USF2Q15853 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USF2Q15853 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
USF2Q15853 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
USF2Q15853 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USF2Q15853 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USF2Q15853 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USF2Q15853 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USF2Q15853 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USF2Q15853 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
USF2Q15853 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
USF2Q15853 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
USF2Q15853 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
USF2Q15853 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
USF2Q15853 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
USF2Q15853 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
USF2Q15853 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
USF2Q15853 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
USF2Q15853 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
USF2Q15853 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
USF2Q15853 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
USF2Q15853 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
USF2Q15853 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC1.38□□□□□ -2.19
USF2Q15853 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.38□□□□□ -2.19
USF2Q15853 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
USF2Q15853 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
USF2Q15853 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
USF2Q15853 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
USF2Q15853 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
USF2Q15853 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
USF2Q15853 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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