Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC1.33□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.33□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.33□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.31□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
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