Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE3CQ15386 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms