Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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