Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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