Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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BRD3Q15059 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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BRD3Q15059 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
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BRD3Q15059 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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BRD3Q15059 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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BRD3Q15059 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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BRD3Q15059 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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BRD3Q15059 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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