Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KARSQ15046 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KARSQ15046 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KARSQ15046 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KARSQ15046 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KARSQ15046 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KARSQ15046 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KARSQ15046 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KARSQ15046 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KARSQ15046 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KARSQ15046 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KARSQ15046 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KARSQ15046 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KARSQ15046 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KARSQ15046 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KARSQ15046 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KARSQ15046 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KARSQ15046 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KARSQ15046 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KARSQ15046 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KARSQ15046 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KARSQ15046 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KARSQ15046 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KARSQ15046 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KARSQ15046 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KARSQ15046 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KARSQ15046 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KARSQ15046 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KARSQ15046 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KARSQ15046 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KARSQ15046 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KARSQ15046 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KARSQ15046 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KARSQ15046 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KARSQ15046 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KARSQ15046 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KARSQ15046 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KARSQ15046 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KARSQ15046 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KARSQ15046 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KARSQ15046 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KARSQ15046 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KARSQ15046 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KARSQ15046 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KARSQ15046 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KARSQ15046 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KARSQ15046 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KARSQ15046 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KARSQ15046 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KARSQ15046 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KARSQ15046 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KARSQ15046 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KARSQ15046 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KARSQ15046 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
KARSQ15046 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
KARSQ15046 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KARSQ15046 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KARSQ15046 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KARSQ15046 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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