Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
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SHPRHQ149N8 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
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SHPRHQ149N8 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
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SHPRHQ149N8 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
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SHPRHQ149N8 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
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SHPRHQ149N8 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
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SHPRHQ149N8 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
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SHPRHQ149N8 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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