Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.4 ms