Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF235Q14590 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF235Q14590 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms