Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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COL9A2Q14055 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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COL9A2Q14055 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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COL9A2Q14055 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
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COL9A2Q14055 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
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COL9A2Q14055 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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