Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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CKAP5Q14008 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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CKAP5Q14008 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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CKAP5Q14008 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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CKAP5Q14008 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
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CKAP5Q14008 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
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CKAP5Q14008 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
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CKAP5Q14008 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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