Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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DDX39BQ13838 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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DDX39BQ13838 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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