Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
APOFQ13790 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
APOFQ13790 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
APOFQ13790 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
APOFQ13790 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
APOFQ13790 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
APOFQ13790 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
APOFQ13790 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
APOFQ13790 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
APOFQ13790 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
APOFQ13790 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
APOFQ13790 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC1.36□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
APOFQ13790 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
APOFQ13790 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
APOFQ13790 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.3 ms