Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NCOA4Q13772 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms