Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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