Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRQ13535 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRQ13535 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRQ13535 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRQ13535 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRQ13535 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRQ13535 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRQ13535 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRQ13535 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRQ13535 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRQ13535 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRQ13535 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRQ13535 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRQ13535 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRQ13535 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRQ13535 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRQ13535 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRQ13535 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRQ13535 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRQ13535 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRQ13535 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRQ13535 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRQ13535 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRQ13535 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRQ13535 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRQ13535 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRQ13535 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRQ13535 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRQ13535 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRQ13535 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRQ13535 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRQ13535 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATRQ13535 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRQ13535 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRQ13535 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRQ13535 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRQ13535 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRQ13535 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRQ13535 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRQ13535 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRQ13535 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRQ13535 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRQ13535 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRQ13535 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRQ13535 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRQ13535 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATRQ13535 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ATRQ13535 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ATRQ13535 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ATRQ13535 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ATRQ13535 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
ATRQ13535 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ATRQ13535 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ATRQ13535 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
ATRQ13535 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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