Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
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